Szárazságtűrésben szerepet játszó SNP-k azonosítása kocsánytalan tölgy populációkban: alapkutatási eredmények a fenntartható tölgygazdálkodásért
نویسندگان
چکیده
Állományalkotó fafajaink genetikai állományban fellelhetőek az alkalmazkodási folyamatok lenyomatai, amelyek fontos ismereteket szolgáltathatnak a klímaadaptációt segítő erdőművelési stratégiák meghatározásához. Jelen kutatásunk során 18 közép- és délkelet-európai kocsánytalan tölgy [Quercus petraea (Matt.) Liebl.] populáció egyedeiben kimutatott SNP-k (egypontos nukleotid eltérések) zárvatermő növények genomjában meghatározott, szárazságtűréssel kapcsolatba hozható szekvenciák kocsányos (Quercus robur L.) referencia genomra történő térképezését végeztük el, meghatározva így azon csoportját, hozhatók szárazsági stresszválaszban szerepet játszó folyamatokkal. A kiugró FST értékkel bíró marker lókuszok összesen 94 klimatikus változó bevonásával végzett regresszióanalízis 16 erősen szignifikáns kapcsolatot mutattunk ki egyes génhelyek néhány, csapadék vagy hőmérséklet alapú környezeti között. szárazság szelekció alatt álló kimutatása számos további, fenntartható tölgygazdálkodást megalapozó kutatás alapját képezheti jövőben.
منابع مشابه
Characterization of flavonoid biosynthesis in apricot and sour cherry fruits
s in Hungarian language 1) Pfeiffer P., Hermán R., Pedryc A., Hegedűs A. (2009): RNS-kivonás optimalizálásakülönböző érettségű kajszi, őszibarack és meggy gyümölcsökből. XV. NövénynemesítésiTudományos Napok, 2009. március 17., Összefoglalók (Szerk.: Veisz, O.), MTA,Budapest, p. 118. 2) Hegedűs A., Pfeiffer P., Pedryc A., György Zs., Halász J. (2009): A kajszigyümölcsflavonoid-bi...
متن کاملThe Framingham Heart Study 100 K SNP Genome - Wide
Background: The Framingham Heart Study (FHS), founded in 1948 to examine the epidemiology of cardiovascular disease, is among the most comprehensively characterized multi-generational studies in the world. Many collected phenotypes have substantial genetic contributors; yet most genetic determinants remain to be identified. Using single nucleotide polymorphisms (SNPs) from a 100K genome-wide sc...
متن کاملThe Framingham Heart Study 100 K SNP Genome - Wide Association
Background: The Framingham Heart Study (FHS), founded in 1948 to examine the epidemiology of cardiovascular disease, is among the most comprehensively characterized multi-generational studies in the world. Many collected phenotypes have substantial genetic contributors; yet most genetic determinants remain to be identified. Using single nucleotide polymorphisms (SNPs) from a 100K genome-wide sc...
متن کاملSNP-Flankplus: SNP ID-centric retrieval for SNP flanking sequences
UNLABELLED The flanking sequences provided by dbSNP of NCBI are usually short and fixed length without further extension, thus making the design of appropriate PCR primers difficult. Here, we introduce a tool named "SNP-Flankplus" to provide a web environment for retrieval of SNP flanking sequences from both the dbSNP and the nucleotide databases of NCBI. Two SNP ID types, rs# and ss#, are acce...
متن کاملSKM-SNP: SNP markers detection method
SKM-SNP, SNP markers detection program, is proposed to identify a set of relevant SNPs for the association between a disease and multiple marker genotypes. We employ a subspace categorical clustering algorithm to compute a weight for each SNP in the group of patient samples and the group of normal samples, and use the weights to identify the subsets of relevant SNPs that categorize these two gr...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Erdészettudományi közlemények
سال: 2022
ISSN: ['2062-6711']
DOI: https://doi.org/10.17164/ek.2022.05